Pacients izmeklējuma dienā nedrīkst ēst! Iepriekšējā vakarā vēlamas vieglas vakariņas, bet ne vēlāk kā plkst. 19. Pēc vakariņām drīkst dzert tikai ūdeni bez gāzes. Nozīmētos perorālos medikamentus jāizdzer ne vēlāk kā 6 stundas pirms endoskopijas ar nelielu ūdens daudzumu. Šķidruma dzeršana aizliegta 4 stundas pirms izmeklējuma.
Augšējās endoskopijas laikā bez speciālas iepriekšējas pacienta sagatavošanas vajadzības gadījumā ir iespējams veikt dažādas diagnostiskas un terapeitiskas manipulācijas kā biopsijas, asiņošanas apturēšanu, polipa izgriešanu, svešķermeņu izņemšanu u.tml..